Attività Didattica, Didattica Integrativa e Servizio Agli Studenti
Didattica in Corsi di Laurea tenuti presso l’università di Catanzaro
- Dall’A.A. 2021/2022 svolge insegnamenti anche per il Corso di Laurea di Scienze delle Investigazioni, presso il Dipartimento di Giurisprudenza dell’Università degli Studi “Magna Græcia” di Catanzaro:
- A.A. 2024/2025 (5 insegnamenti, 23 CFU )
- [L-18] ECONOMIA AZIENDALE
- Elementi di Informatica (2 CFU)
- [LM-63] SCIENZE DELLE PUBBLICHE AMMINISTRAZIONI E ORGANIZZAZIONI COMPLESSE
- Informatica e Data Management (8 CFU)
- [L-40] SOCIOLOGIA
- Abilità Informatiche (4 CFU)
- [L-14] SCIENZE DELLE INVESTIGAZIONI:
- Elementi Di Informatica E Di Analisi Dei Dati (6 CFU)
- SCUOLA DI SPECIALIZZAZIONE IN PATOLOGIA CLINICA E BIOCHIMICA CLINICA:
- Sistemi di Elaborazione delle Informazioni (2 CFU)
- Dottorato in Biomarcatori delle Malattie Croniche e Complesse
- Analisi di Pathway Biologici (1 CFU)
- A.A. 2023/2024 (5 insegnamenti, 23 CFU)
- [L-18] ECONOMIA AZIENDALE
- Elementi di Informatica (2 CFU)
- [LM-63] SCIENZE DELLE PUBBLICHE AMMINISTRAZIONI E ORGANIZZAZIONI COMPLESSE
- Informatica e Data Management (8 CFU)
- [L-40] SOCIOLOGIA
- Abilità Informatiche (4 CFU)
- [L-14] SCIENZE DELLE INVESTIGAZIONI:
- Elementi Di Informatica E Di Analisi Dei Dati (6 CFU)
- SCUOLA DI SPECIALIZZAZIONE IN PATOLOGIA CLINICA E BIOCHIMICA CLINICA:
- Sistemi di Elaborazione delle Informazioni (2 CFU)
- Dottorato in Biomarcatori delle Malattie Croniche e Complesse
- Analisi di Pathway Biologici (1 CFU)
- A.A. 2022/2023 (5 insegnamenti, 23 CFU)
- [L-18] ECONOMIA AZIENDALE
- Elementi di Informatica (2 CFU)
- [LM-63] SCIENZE DELLE PUBBLICHE AMMINISTRAZIONI E ORGANIZZAZIONI COMPLESSE
- Informatica e Data Management (8 CFU)
- [L-40] SOCIOLOGIA
- Abilità Informatiche (4 CFU)
- [L-14] SCIENZE DELLE INVESTIGAZIONI:
- Elementi Di Informatica E Di Analisi Dei Dati (6 CFU)
- SCUOLA DI SPECIALIZZAZIONE IN PATOLOGIA CLINICA E BIOCHIMICA CLINICA:
- Sistemi di Elaborazione delle Informazioni (2 CFU)
- Dottorato in Biomarcatori delle Malattie Croniche e Complesse
- Analisi di Pathway Biologici (1 CFU)
- A.A. 2021/2022 (5 insegnamenti, 23 CFU)
- [L-18] ECONOMIA AZIENDALE
- Elementi di Informatica (2 CFU)
- [LM-63] SCIENZE DELLE PUBBLICHE AMMINISTRAZIONI E ORGANIZZAZIONI COMPLESSE
- Informatica e Data Management (8 CFU)
- [L-40] SOCIOLOGIA
- Abilità Informatiche (4 CFU)
- [L-14] SCIENZE DELLE INVESTIGAZIONI:
- Elementi Di Informatica E Di Analisi Dei Dati (6 CFU)
- SCUOLA DI SPECIALIZZAZIONE IN PATOLOGIA CLINICA E BIOCHIMICA CLINICA:
- Sistemi di Elaborazione delle Informazioni (2 CFU)
- Dottorato in Biomarcatori delle Malattie Croniche e Complesse
- Analisi di Pathway Biologici (1 CFU)
- A.A. 2020/2021 (3 insegnamenti, 14 CFU)
- [L-18] ECONOMIA AZIENDALE
- Elementi di Informatica (2 CFU)
- [LM-63] SCIENZE DELLE PUBBLICHE AMMINISTRAZIONI E ORGANIZZAZIONI COMPLESSE
- Informatica e Data Management (8 CFU)
- [L-40] SOCIOLOGIA
- Abilità Informatiche (4 CFU)
- Dall’A.A. 2010/2011 ha svolto in qualità di titolare di insegnamenti sia presso il Corso di Laurea in Ingegneria Informatica e anche presso alcuni Corsi di Laurea di area bio-medica della Scuola di Medicina e Chirurgia dell’Università di Catanzaro. In particolare:
- A.A. 2019/2020 (2 insegnamenti, 9 CFU)
- Ingegneria Informatica e Biomedica (D.M. 270/04)- C.I. di Sistemi Operativi, Reti e Programmazione – Modulo di Sistemi Operativi e Reti di Calcolatori (6 CFU)
- Professioni sanitarie, infermieristiche e professione sanitaria ostetrica: C.I. di Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)
- A.A. 2018/2019 (2 insegnamenti, 12 CFU)
- Ingegneria Informatica e Biomedica (D.M. 270/04)-C.I. di Sistemi Operativi, Reti e Programmazione – Modulo di Sistemi Operativi e Reti di Calcolatori (6 CFU)
- Scienze zootecniche e tecnologie delle produzioni animali (D.M. 270/04)-Elementi di informatica per le aziende zootecniche e di trasformazione (6 CFU)
- A.A. 2017/2018 (1 insegnamento, 6 CFU)
- Ingegneria Informatica e Biomedica (D.M. 270/04) - C.I. di Sistemi Operativi, Reti e Programmazione – Modulo di Sistemi Operativi e Reti di Calcolatori (6 CFU)
- A.A. 2016/2017 (4 insegnamenti, 15 CFU)
- Ingegneria Informatica e Biomedica (D.M. 270/04)-C.I. di Sistemi Operativi, Reti e Programmazione – Modulo di Sistemi Operativi e Reti di Calcolatori (6 CFU)
[L/SNT2] Professioni sanitarie della riabilitazione e [L/SNT3] Professioni sanitarie tecniche (TRONCO COMUNE 3e4)
- C.I. Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)- in Professioni sanitarie, infermieristiche e professione sanitaria ostetrica
- C.I. di Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)- Professioni sanitarie della riabilitazione e [L/SNT3] Professioni sanitarie tecniche (TRONCO COMUNE 2)
- C.I. Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)
- A.A. 2015/2016 (2 insegnamenti, 9 CFU)
- Ingegneria Informatica e Biomedica (D.M. 270/04)- C.I. di Sistemi Operativi, Reti e Programmazione – Modulo di Sistemi Operativi e Reti di Calcolatori (6 CFU) in Professioni sanitarie, infermieristiche e professione sanitaria ostetrica
- C.I. di Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)
- A.A. 2014/2015 (1 insegnamento, 3 CFU)
- Professioni sanitarie, infermieristiche e professione sanitaria ostetrica - C.I. di Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)
- A.A. 2011/2012 (1 insegnamento, 1 CFU)
- Ingegneria Informatica e Biomedica (D.M. 270/04)- Didattica integrativa Fondamenti di Informatica I e II (30 ore)
- A.A. 2010/2011 (3 insegnamenti, 9 CFU)
- Professioni sanitarie, infermieristiche e professione sanitaria ostetrica - C.I. di Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)
- Professioni sanitarie, infermieristiche e professione sanitaria ostetrica - C.I. di Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)
- Professioni sanitarie, infermieristiche e professione sanitaria ostetrica - C.I. di Scienze Fisiche, Informatiche e Statistiche - Modulo di Informatica I anno (3 CFU su totale 6 CFU)
- Didattica in Corsi Di Laurea Tenuti Presso l'Università della Calabria
- Dal 2009 al 2010 l’attività didattica è stata svolta prevalentemente in qualità di esercitatore di insegnamenti attivati in numerosi corsi di studio delle Facoltà di Economia e Scienze Matematiche, dell’Università della Calabria, e del Dipartimento DEIS:
- A.A. 2009/2010
- Esercitatore nel corso di “Progettazione di Sistemi Informativi” di Laurea in Ingegneria Gestionale, presso la Facoltà di Ingegneria dell’Università della Calabria
- Esercitatore del corso di “Algoritmi e Programmazione” (30 ore) Corso di Laurea in Metodi Quantitativi perl’Economia e la Gestione delle Aziende presso la Facoltà di Economia dell’Università della Calabria.
- Esercitatore del corso di “Programmazione Orientata agli Oggetti”, (30 ore) Corso di Laurea in Metodi Quantitativi per l’Economia e la Gestione delle Aziende presso la Facoltà di Economia dell’Università della Calabria
- Esercitatore nel corso di “Introduzione all’informatica e laboratorio di base” (15 ore) Corso di Laurea Magistrale in giurisprudenza presso la Facoltà di Economia dell’Università della Calabria.
- A.A. 2010/2011
- Esercitatore nel corso di “Fondamenti di Informatica”, (40 ore) corso di Laurea in Statistica per le Aziende e le Assicurazioni presso la Facoltà di Economia dell’Università della Calabria
- Esercitatore nel corso di “Programmazione Orientata agli Oggetti” (30 ore) Corso di Laurea in Metodi Quantitativi per l’Economia e la Gestione delle Aziende presso la Facoltà di Economia dell’
- Didattica in Corsi di Dottorato
Ha svolto attività di docenza in corsi del Dottorato di ricerca in Biomarcatori delle Malattie Croniche e Complesse Università Magna Græcia di Catanzaro ed in particolare:
- A.A. 2016/2017
- corso “Preprocessing ed analisi di dati omici” per un totale di 2 CFU, pari a 16 ore.
- A.A. 2016/2017
- corso “Data Mining e Scoperta di Conoscenza in Medicina” per un totale di 2 CFU, pari a 16 ore
- A. 2023/2024
- corso “Analisi di Pathway Biologici” per un totale di 1 CFU, pari a 8 ore.
- A. 2022/2023
- corso “Analisi di Pathway Biologici” per un totale di 1 CFU, pari a 8 ore.
- A. 2020/2021
- corso “Analisi di Pathway Biologici” per un totale di 1 CFU, pari a 8 ore.
- A. 2018/2019
- corso “Analisi Statistica e Data Mining di Dati Omici” per un totale di 3 CFU, pari a 24 ore.
- Didattica in Master Universitari e Corsi di Formazione
Ha svolto attività di docenza in corsi di master universitari:
- 2015 luglio
- modulo “Tecniche di data mining avanzato applicate alle neuroscienze” CFU 2 pari a 50 Ore. Presso il Master di 1° livello “Web-Services in Medicina. Neuromeasures e Diagnosi clinica” dell’Università Magna Graecia di Catanzaro
- 2016 Maggio
- Modulo B: “Lo sviluppo di nuovi modelli di gestione clinica, sostenibilità ed incremento dell'efficienza” CFU 1 pari a 25 Ore. Presso il Master di 1° livello “Applicazioni E Processi Innovativi In Cardiologia Endovascolare E Clinica (CARDIOAPPEAL)” dell’Università Magna Graecia di Catanzaro.
- 2016 Maggio
- Modulo B: “Strumenti innovativi ICT quale risorsa strategica per le nuove imprese” CFU 1 pari a 25 Ore. Presso il Master di 1° livello “Applicazioni E Processi Innovativi In Cardiologia Endovascolare E Clinica (CARDIOAPPEAL)” dell’Università Magna Graecia di Catanzaro
- Coordinamento, Supervisione e Avviamento alla Ricerca
Ha svolto con continuità attività di formazione alla ricerca ed in tale contesto ha coordinato e supervisionato studenti di laurea magistrale nelle attività connesse con tesi di ricerca sperimentali.
- A. 2021- oggi - Tutor presso il Dottorato di Ricerca dal titolo "Metodi e tecniche dell'ingegneria informatica per la modellazione, gestione ed analisi efficiente dei dati", nell’ambito del corso di Dottorato di Ricerca in “Biomarcatori delle malattie croniche e complesse”, Ciclo XXXVII, presso l’Università Magna Græcia di Catanzaro.
- Attività Scientifica
L’attività di ricerca affronta tematiche centrali del Settore Scientifico Disciplinare ING-INF/05 con particolare riferimento al data mining, al calcolo parallelo e distribuito, e alla bioinformatica . Più recentemente, ha ampliato le sue ricerche integrando l'intelligenza artificiale (IA) in nuovi ambiti, tra cui l'analisi di documenti giuridici e la gestione di big data
- Le principali attività di ricerca si sono focalizzate sulla definizione, realizzazione e validazione di:
- sistemi di analisi di dati omici (termine con il quale si indicano le discipline biomolecolari che presentano il suffisso “-omica”, come genomica, proteomica) basati sull’uso di analisi statistiche avanzate, machine learning e data-mining, al fine di sviluppare strumenti e metodologie innovative da poter essere applicate in casi d'uso reali . Più recentemente, sono stati integrati modelli di GPU computing e edge computing, permettendo analisi genomiche in tempo reale e riducendo drasticamente i costi computazionali
- algoritmi innovativi per la modellazione, memorizzazione e visualizzazione di reti Biologiche (l’insieme delle interazioni tra molecole biologiche in un organismo, usualmente rappresentate come un grafo). Implementazione di algoritmi innovativi per la visualizzazione efficiente delle reti biologiche, risolvendo problematiche legate alla densità di grafi con migliaia di nodi e archi. Infine, ottimizzazione delle architetture computazionali per memorizzare e analizzare grandi grafi biologici su sistemi multi-core e distribuiti
- algoritmi e metodologie di data mining innovati per supportare i curatori di ontologie nel processo di valutazione della consistenza dei termini ontologici, mediante strumenti software automatici. Sono stati sviluppati strumenti e metodologie per estrarre regole di associazione tra termini di diverse ontologie (cross-ontology association rules), contribuendo a migliorare la comprensione della struttura e della funzione delle proteine
- Più di recente le attività si sono anche concentrate su metodologie e modelli Cloud e Web Computing per l’analisi efficiente di enormi volumi di dati genomici.
- Le ricerche condotte hanno trovato ampia sperimentazione in ambiti applicativi emergenti quali la medicina P4 (Partecipativa, Preventiva, Predittiva e Personalizzata) e la farmacogenomica. Come parte di un'espansione interdisciplinare, il Prof. Agapito ha applicato tecniche di natural language processing (NLP) e machine learning per l'analisi di grandi volumi di documenti giuridici. L'obiettivo è automatizzare il processo di estrazione di conoscenze da contratti, sentenze e normative, riducendo il tempo necessario per identificare clausole rilevanti, incongruenze o conflitti normativi. Durante la pandemia di COVID-19, l’attività di ricerca si è focalizzata sull’analisi delle varianti genetiche del virus SARS-CoV-2 e delle loro implicazioni cliniche. I risultati ottenuti sono documentati in pubblicazioni scientifiche indicizzate SCOPUS e WoS, in riviste internazionali, articoli a conferenze e workshop, capitoli di libri, capitoli in Enciclopedie, e Editorial.
- Periodi di Ricerca all’Estero
- 03/0621 – oggi - Partecipa al Consorzio per la Caratterizzazione Clinica del COVID-19 tramite Dati di Cartelle Cliniche Elettroniche (4CE), coordinato dalla Harvard Medical School, per l’analisi delle cartelle cliniche elettroniche (EHR) relative al COVID-19. Il progetto si avvale di un dataset composto da oltre 36.500 pazienti, raccolti da 342 ospedali in tutto il mondo. Questa collaborazione mira a estrarre conoscenze clinicamente rilevanti per supportare la gestione della pandemia e lo sviluppo di strategie terapeutiche basate su evidenze globali.
- 6/04//2017 – 26/09//2017
- Visiting Scientist – (Research Fellow) (S.C. 09/H1 - Sistemi di Elaborazione delle Informazioni, S.S.D. INGINF/05 - Sistemi di Elaborazione delle Informazioni) del gruppo di ricerca del Prof. Igor Jurisica presso l’University Health Network, Princess Margaret Cancer Center, Toronto Canada. Presso il JurisicaLab in qualità di Research Fellow, ha consolidato le sue competenze scientifiche su calcolo parallelo, data mining e analisi di reti biologiche (in particolare Pathway Biologici). I risultati delle attività di ricerca sono stati pubblicati in riviste scientifiche.
- 30/04/12 – 19/04/13
- Visiting short-term Research Scholar – (S.C. 09/H1 - Sistemi di Elaborazione delle Informazioni, S.S.D. ING-INF/05 - Sistemi di Elaborazione delle Informazioni) University Health Network, JurisicaLab Princess Margaret Cancer Center, Toronto Canada. Presso il JurisicaLab ha proseguito le sue attività di ricerca su calcolo parallelo e data mining, iniziando lo studio di tematiche teoriche e metodologiche incentrate sull'analisi, integrazione e visualizzazione di reti biologiche
- Attività di Servizio alla Ricerca
- 3.2.1 Comitati Editoriali di Riviste.È membro del comitato editoriale delle seguenti riviste internazionali:
- Big Data and Cognitive Computing (MDPI)
- 3.2.2 Organizzazione di Numeri Speciali in Riviste e Libri .È attivo nell’organizzazione di numeri speciali su riviste internazionali nonché di un libro in collana internazionale, di
seguito riportati:
- (2019) Big Data and Cognitive Computing (MDPI AG, Basel, Switzerland), Special Issue "Big Data in Omics Science: Challenges and Opportunities". Guest Editors: G Agapito
- (2018) Computers Journal (MDPI AG, Basel, Switzerland), Special Issue "Selected Papers from the Workshop on Biomedical and Bioinformatics Challenges for Computer Science (BBC 2018)”. Guest Editors: G Agapito, M Cannataro, M Castelli, R Dondi, I Zoppis
- (2017) Computers Journal (MDPI AG, Basel, Switzerland), Special Issue "Selected Papers from the Workshop on Biomedical and Bioinformatics Challenges for Computer Science (BBC 2017)”. Guest Editors: G Agapito, M Cannataro, M Castelli, R Dondi, I Zoppis
- Attività Di Revisione Scientifica
- Svolge intensa attività di revisione per riviste internazionali, tra cui importanti journal IEEE, Elsevier, ACM e Springer della sua area di ricerca. Nel seguito si riporta l’elenco delle riviste raggruppate per casa editrice:
- ACM - ACM Transactions, Bioinformatics;
- Springer Nature - BMC Bioinformatics; BMC Medical Genomics
- Oxford University Press - Briefings in Bioinformatics;
- Elsevier: Computer Methods and Programs in Biomedicine
- IEEE: IEEE Transactions on Computers; - IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems;
- Plos - Plos One.
- MDPI - High-Throughput - Data - Computers - Big Data and Cognitive Computing
